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系统简介

宏基因组测序mNGS(Metagenome Next Generation Sequencing)—— 是指对特定样品中的全部病原体 基因组进行高通量测序,该方法能够快速、准确、高效地获得整个病原体群体的基因组信息。宏基因组测序不依 赖于病原体的分离培养,可以得到样品中丰度较低甚至是痕量病原体的信息。近年来,宏基因组测序越来越多的 应用于医学和兽医研究及临床诊断领域。 VETKNOW动物病原宏基因组分析系统是专门针对动物病原微生物宏基因组数据分析的软件。VETKNOW有 自行研发的数据库,数据库收录了包含兽医常见病原微生物在内的8000种病毒,30000种细菌(包含分枝杆 菌、支原体/衣原体和螺旋体),及猪牛羊鸡鸭鹅犬猫等宿主信息。分析结果可显示病原、比对序列数 (reads),物种分类及农业农村部一二三类动物疫病信息等

装载测序分析流程

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动物病原宏基因组分析系统

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与现有其他病原快速鉴定系统相比较,VETKNOW拥有以下特点

内置物种数据库

包括10种以上的宿主物种,人、猪、山羊、绵羊、小鼠等;同时,支持定制化开发更多宿主物种。

收录超过2.7万种微生物,含新冠病毒序列,支持定期更新

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